10 aprile 2019

PubMed Labs - Nuovi aggiornamenti

In queste ultime settimane troviamo due nuovi aggiornamenti alla piattaforma di PubMed Labs:  l'aggiunta del Clipboard per il salvataggio temporaneo di articoli e riviste (disponibile fino 8 ore senza registrazione e attivo anche se ci si scollega e poi ricollega a PubMed) e la disponibilità della opzione di Advanced search (attenzione solo da qui vedo come è stata elaborata la nostra stringa di ricerca, ovvero ciò che nella versione attuale di PubMed compare nella finestra Details)

09 aprile 2019

Cefalea.it - Blog di interesse

Vi segnalo il sito Cefalea.it della Fondazione Cirna ONLUS che contiene informazioni per i pazienti che soffrono di questa patologia e un blog nato nel 2013 che tra i contributi include la rassegna stampa di articoli tematici.
Tra le riviste tematiche italiane ad accesso gratuito: Confinia Cephalalgica et Neurologica, indicizzata anche dalla base dati bibliografica Scopus.


03 aprile 2019

Ten myths around open scholarly publishing - Articolo di interesse

Bibliosan 2.0 segnala in un post del 14 marzo un interessante articolo sull'editoria ad accesso aperto, è in formato preprint ed è stato pubblicato in PeerJ
Tennant JP, Crane H, Crick T, Davila J, Enkhbayar A, Havemann J, Kramer B, Martin R, Masuzzo P, Nobes A, Rice C, Rivera-López BS, Ross-Hellauer T, Sattler S, Thacker P, Vanholsbeeck M. 2019. Ten myths around open scholarly publishing. PeerJ Preprints 7:e27580v1 https://doi.org/10.7287/peerj.preprints.27580v1 



PubMed Labs - Futura piattaforma per PubMed?

La NLM sta preparando una nuova interfaccia di accesso al database PubMed. Il nuovo PubMed Labs che fornisce anche un layout ottimale per l’accesso ai contenuti di PubMed da telefonini e tablet è ancora in fase di testing ed è oggetto di continue migliorie  (attualmente la nuova piattaforma non ha tutte le potenzialità di ricerca di quella tradizionale). Nel fascicolo n. 427, March-April 2019, dello NLM Technical Bulletin trovate le novità più recenti.

27 marzo 2019

Web of Science - Informazioni nel Blog italiano di Claryvate Analytics

L'editore Claryvate Analytics ha creato un blog italiano, che include oltre a informazioni sulle novità editoriali e commerciali, incluse informazioni sulla base dati Web of Science

21 gennaio 2019

L'Istituto Superiore di Sanità ha attivato VigiErbe un sistema online per la segnalazione delle reazioni avverse dovuti a integratori alimentari, prodotti erboristici, preparazioni magistrali (per esempio a base di cannabis per uso medico), medicinali omeopatici privi di Aic e altri prodotti di origine naturale. Il sito è attivo dal 12 dicembre del 2018, è stato sviluppato dall'Università di Verona ed è raggiungibile e utilizzabile sia da sistemi fissi che mobili, non prevede la registrazione per l'utilizzo ed è aperto sia alle segnalazioni dei medici che a quelle dei cittadini
Per ulteriori informazioni leggete la notizia apparsa il 20 gennaio nel periodico Fitoterapia33

29 ottobre 2018

Safety Chemistry - Un nuovo portale per la ricerca di informazioni di qualità

Il portale Chemical Safety Gateway integra risorse gratuite (Toxnet, PubChem e molte altre) e risorse in abbonamento della biblioteca per una ricerca di informazioni di qualità. E' un prodotto della Deep Web Technologies. Possiamo vedere la presentazione nella pagina iniziale e anche leggere l'articolo pubblicato nella rivista Journal of Chemical Health & Safety:
Lederman, A., & Lederman, S. (2018). The chemical safety gateway: Beyond Google’s limitations. Journal of Chemical Health and Safety, 25(3), 11–16. https://doi.org/10.1016/j.jchas.2017.11.001
L'intero fascicolo del giornale è dedicato a "Chemical Safety Information in the 21st Century"

PubMed - I filtri per le metodologie di ricerca

E' sempre più un problema riuscire a fare una ricerca esaustiva, oltre al MeSH abbiamo bisogno di usare dei termini liberi (non tutti i record di PubMed hanno i termini del tesauro). Un aiuto ci viene dal blog "Your Own Private Librarian". Per cercare in PubMed articoli di systematic review, meta-analysis o altro, seguire i suggerimenti di questa pagina.

05 settembre 2018

Ministero della Salute: Farmacopea Ufficiale XII ed. - Aggiornamenti maggio-agosto 2018

L'aggiornamento ha visto un primo decreto del Ministero della salute del 17 maggio (Gazzetta ufficiale n. 129 del 6 giugno 2018), che contiene, in particolare, aggiornamenti riguardanti le Tabelle 2, 4, 5, 6, 7 e 8, i sottocapitoli concernenti il "controllo delle impurezze" e le "impurezze elementali", le monografie concernenti le "preparazioni farmaceutiche" e le "sostanze per uso farmaceutico", e un successivo decreto del 24 luglio (GU n. 188 del 14 agosto 2018), con aggiornamento della Tabella n. 3 della XII edizione della Farmacopea ufficiale della Repubblica italiana, approvata con decreto 3 dicembre 2008 e rettifica delle Tabelle nn. 2 e 6 del decreto 17 maggio 2018, recante: «Aggiornamento e revisione di alcuni testi della XII edizione della Farmacopea ufficiale della Repubblica italiana». (18A05383)

10 luglio 2018

La Scienza Aperta - Moduli formativi gratuiti

Bibliosan 2.0 in un post del 5 luglio segnala dei corsi gratuiti sulla Scienza aperta proposti dal progetto FOSTER (Facilitate Open Science Training for European Research)

22 giugno 2018

PubMed - statistiche 2017

Sono disponibili le statistiche 2017 per il database PubMed. Possiamo vederle in dettaglio da questa pagina.

National Library of Medicine - Nuova Pagina Web

La NLM ha aggiornato la sua pagina web (leggi la notizia). La nuova versione che raccoglie le risorse più importanti ed evidenzia le icone per l'accesso ai database (PubMed,  TOXNET, MedlinePlus, BLAST) coesisterà on la vecchia fino a luglio.
Attenzione però, se accediamo da questa nuova pagina non vediamo il linking alle risorse di ateneo! Ricordiamo sempre di collegarci con  la url di accesso a PubMed che è stata creata per l'ateneo di Padova.

21 giugno 2018

Periodicals - Crea la tua rivista online

Un articolo del 15 giugno apparso in Bibliosan 2.0 segnala questa risorsa, lanciata da PubPeer, che permette ai ricercatori di creare una rivista online selezionando preprint, o articoli già esistenti, ritenuti interessanti per il proprio ambito di ricerca. La piattaforma Peeriodicals fornisce agli utenti registrati tutti gli strumenti necessari per creare una o più riviste. I lettori possono registrarsi ad una o più riviste e ricevere gli aggiornamenti.
Per creare un account è necessario: "Please provide the DOI of a paper you have authored, select your name from the author list and enter an institutional email address."

20 giugno 2018

AntibioticDB, an open access database to aid antibacterial research and development

Un articolo della rivista Journal of Antimicrobial Chemotherapy annuncia la nascita di un nuovo database:
L J Farrell, R Lo, J J Wanford, A Jenkins, A Maxwell, L J V Piddock; Revitalizing the drug pipeline: AntibioticDB, an open access database to aid antibacterial research and development, Journal of Antimicrobial Chemotherapy, , dky208, https://doi.org/10.1093/jac/dky208
 Il database include composti in fase preclinica, composti non più studiati o in diverse fasi di sperimentazione. Un video illustra le modalità di interrogazione.



Peer-review degli articoli - Coinvolgimento dei Pazienti

Oggi il blog The Scholarly Kitchen pubblica una interessante intervista di Kent Anderson riguardante l'iniziativa di BMJ, mirata a coinvolgere pazienti con particolari problemi di salute e coloro che se ne prendono cura (caregivers) nel processo di revisione degli articoli. Una interessante innovazione nel processo di peer-review, argomento sempre scottante.
Tra i commenti all'articolo, uno di particolare interesse che riguarda Cochrane.org e l'iniziativa (a partire dal 1984) di coinvolgere i consumatori di varie nazioni nel mondo nella produzione di informazioni basate sull'evidenza. Per saperne di più consultare il sito Cochrane Consumer Network

14 giugno 2018

Altmetrics for Librarians - ebook

Nel sito di Altmetrics è disponibile un ebook dal titolo "Altmetrics for Librarians: 100+ tips, tricks and examples" per i bibliotecari che vogliono esplorare le metriche alternative. Nelle pagine finali è presente anche una guida alle fonti informative che permettono di mantenerci aggiornati sugli sviluppi futuri di queste metriche. E' possibile consultare il testo online o scaricare il pdf.

03 maggio 2018

NLM - Learning Resources Database

Il database della NLM "Learning Resources Database Redesign" è stato ridisegnato; un'unica interfaccia consente la ricerca di tutorials, video, e altre risorse formative per aree disciplinari diverse o una panoramica di tutte le risorse disponibili

26 aprile 2018

PubMed e PubMed Central (PMC) - Filtri per i Dati

Per estrarre articoli e citazioni che contengono dei dati è possibile usare i seguenti filtri da usare da soli o associati a una ricerca:
PubMed Central
1. has suppdata[filter] per trovare articoli con materiale supplementare
2. has data avail[filter] per trovare articoli che includono dati o indicazioni di  disponibilità di dati
3. has data citations[filter] per trovare articoli che includono data citation(s).
oppure

4. has associated data[filter] per recuperare tutti gli articoli indicati sopra ai punti 1, 2 e 3
PubMed
has data[filter] per trovare citazioni con link ai dati presenti nei campi: Secondary Source ID field o LinkOut – Other Literature Resources (entrambi visibili nel record, formato abstract, sotto l'abstract). Questi link possono riguardare dati presenti in altri database della NLM (es. GenBank) o altri repository esterni (es. figshare, Dryad)

13 aprile 2018

National Library of Medicine - On Latin and the Rooster in Medicine

In questo interessante  articolo  apparso nel blog Circulating Now vengono presentate alcune opere antiche in lingua latina (per secoli lingua d'elezione nella medicina antica). I libri sono patrimonio della collezione antica della NLM e  le immagini digitalizzate possono essere ingrandite e viste nei dettagli.
Vi segnalo in particolare la pagina con la ricetta della Theriaca presente nella Pharmacopoeia di Augsburg del 1573 e l'immagine tratta dal testo di Kircher: Musurgia universalis; sive Ars manga consoni et dissonie X. kobros digesta  "… in which the author invokes his ideas on music and how it is reflected by the proportions of the universe. This volume has beautiful musical notations and diagrams of instruments. A famous page from this text presents the musical notes of birdsongs...".
Infine significato e immagini dei testi nei quali è raffigurato un gallo "... In ancient Greece, it was believed that a rooster crowing in the morning would ward off evil spirits and disease. Poultry was a common currency for paying for medical treatments and other services. When Socrates was dying, his famous last recorded words were “I owe a cock to Asclepius, see that it is paid.”

Medicamenta - Storie di malattie e rimedi nei libri antichi della Biblioteca di Scienze del Farmaco dell'Università di Padova

Vi ricordate della mostra Medicamenta, che valorizza i testi antichi (e in particolare le immagini) della nostra biblioteca? E' adesso disponibile anche la versione inglese del testo.
Nella pagina della mostra, alla voce "Mostri e mostruosita'" scegliendo "Il teatro anatomico", si apre la pagina Il teatro anatomico e lo spettacolo del corpo dove è stato aggiunto un bel video sulle opere di Vesalio
Coloro che prendono visione della mostra possono anche compilare un questionario di gradimento, presente come ultima voce del menu.

09 marzo 2018

NatureOutlook - Women's Health

Pubblicato il 5 ottobre, questo fascicolo ad accesso gratuito di Nature è dedicato alla salute delle donne.

8 Marzo - Cambridge Celebrates International Women's Day

Anche quest'anno la Cambridge University Press apre i suoi archivi e mette gratuitamente a disposizione del pubblico una selezione di articoli e di capitoli di libri, frutto dell'ingegno delle donne di varie epoche storiche e di diversi ambiti culturali e scientifici. Interessante anche il loro Cambridge Core blog.

28 febbraio 2018

PubMed - Nuovi Filtri per Argomento

PubMed ha aggiornato le strategie di ricerca (filtri) per i seguenti argomenti : Bioethics, Cancer, Complementary Medicine, Dietary Supplements, Toxicology, Veterinary Science, inoltre ha creato un nuovo filtro Developmental and reproductive Toxicology (DART) per la ricerca di argomenti relativi alla teratologia e la tossicologia riproduttiva

27 febbraio 2018

PubMed - Risorse per i Bibliotecari

Oltre ai webinar, ai video e tutorial accessibili dalla pagina di PubMed, non dimentichiamoci di queste risorse per la formazione dell'utenza create dalla National Library of Medicine nella pagina Instructional Materials for Trainers (le guide brevi sono aggiornate al 2018)

15 febbraio 2018

Blog: Sono ancora strumenti utili?

E' stato pubblicato in Impact of Social Sciences un post interessante di Manu Saunders, una ricercatrice australiana che evidenzia l'attualità e l'utilità dei blog in ambito accademico

13 febbraio 2018

Articolo di interesse: Medical Preprints—A Debate Worth Having, The JAMA Network

A proposito di archivi di archivi di preprint e dati della ricerca, segnalo questo articolo apparso nella rivista JAMA
Maslove DM. Medical Preprints—A Debate Worth Having. JAMA. 2018;319(5):443–444. doi:10.1001/jama.2017.17566
La prevista nascita dell'archivio MedArXiv suggerisce all'autore dell'articolo alcune interessanti riflessioni sulle potenziali conseguenze dell'archiviazione dei dati preliminari della ricerca medica clinica.


Sempre a proposito di preprint, un altro articolo in JAMA evidenzia che le pubblicazioni archiviate come preprint prima di comparire nella rivista come articoli pubblicati ricevono punteggi di Altmetrics maggiori rispetto alle pubblicazioni che non sono presenti negli archivi di preprint
Serghiou S, Ioannidis JPA. Altmetric Scores, Citations, and Publication of Studies Posted as Preprints. JAMA. 2018;319(4):402–404. doi:10.1001/jama.2017.21168

05 febbraio 2018

Periodici Open Access - DOAJ Best Practice Guide e Informazioni sui Periodici

Il blog Bibliosan 2.0 annuncia la nuova guida DOAJ "DOAJ Best Practice Guide", che oltre a chiarire le "politiche" DOAJ di inclusione dei periodici OA fornisce a bibliotecari e ricercatori un ausilio utile per identificare le riviste "autorevoli" (contrassegno DOAJ). Nel sito DOAJ, con l'opzione "Browse subjects" è possibile vedere l'elenco delle discipline e delle sottodiscipline, classificate secondo la Library of Congress, Scelta la disciplina o sottodisciplina di interesse, si visualizza il pulsante "View Journals/Articles", limitare la ricerca ai soli "Journals". Si ottiene l'elenco delle riviste OA e le schede relative, tra le informazione disponibili: tipo di referaggio degli articoli (peer review, double blind peer review, open peer review ecc.), tipo di licenza Creative Commons, costi per la pubblicazione e in alcuni casi anche il costo delle APC (attenzione alla data di aggiornamento dei dati!)

Discovery Tools, a Bibliography - Blog di interesse

Il blog raccoglie bibliografie riguardante argomenti di attualità per i bibliotecari come i discovery tools. Nella bibliografia di gennaio 2018 trovate le novità 2016 e 2017 degli editori e le esperienze delle biblioteche

02 febbraio 2018

La Medicina Domestica nelle Collezioni antiche della NLM e nel fondo della Biblioteca

Ancora un libro di rimedi digitalizzato dalla NLM, all'interno della collezione "Digitizing Material Culture: Handwritten Recipe Books 1600-1900". Si tratta di un libro di rimedi dal titolo "A book of receipts of all sorts" (ricette di cucina, preparazioni farmaceutiche ecc. degli anni dal 1693 al 1730) inizialmente scritto da Elizabeth Strachey ed arricchito dal contributo di altri collaboratori.
La medicina domestica è inclusa tra i contenuti ed è oggetto di trattazione della mostra "Medicamenta, Storie di malattie e rimedi nei libri antichi della Biblioteca di Scienze del Farmaco dell'Università di Padova",  una mostra virtuale che ha lo scopo di far conoscere e valorizzare il fondo antico posseduto della nostra Biblioteca di Scienze del Farmaco

ClinicalTrials.gov - Base dati di studi clinici della NLM

A dicembre, la NLM ha annunciato degli aggiornamenti che faciliteranno la ricerca nel database ClinicalTrials.gov. Il database include gli studi clinici condotti in tutti il mondo, sia con finanziamenti pubblici che privati, in particolar quelli che riguardano i nuovi farmaci in fase di sperimentazione

PubMed - Aiuto nella Formulazione delle Strategie di Ricerca

NLM fornisce un servizio di aiuto a ricercatori e bibliotecari che sono in difficoltà nel creare le loro strategie di ricerca. E' possibile inoltrare una richiesta di aiuto includendo le strategie di ricerca già sperimentate, che possono anche essere recuperate dalla "history" presente nella pagina della ricerca avanzata di PubMed.

23 gennaio 2018

Web of Science - Come escludere Medline

In Web of science sono presenti anche i record Medline. Se ho già fatto la mia ricerca in PubMed e voglio ripeterla in Web of Science ma escludendo i record di Medline, come posso fare? Un video creato dalla Ebling Library e caricato in YouTube ci fornisce utili suggerimenti. Sempre in YouTube possiamo trovare altri video interessanti della biblioteca.

22 gennaio 2018

Predatory o Illigitimate Journals - Cosa sono e come difendersi

Un post di Alice Meadows apparso il 5 dicembre 2017 nel blog The Scholarly kitchen segnala degli articoli pubblicati su riviste del gruppo Nature (Nature e Nature Human Behaviour) che analizzano i profili dei ricercatori che pubblicano sui "predatory journals"  e la distinzione tra "predatory" e "illigitimate journals", proponendo strategie per bloccarne la diffusione.



17 gennaio 2018

2018 Nucleic Acids Research database issue - Le basi dati NCBI

La rivista Nucleic Acids Research pubblica annualmente un fascicolo dedicato ai database. Nel fascicolo D1 del volume 43, pubblicato il 4 gennaio 2018 possiamo leggere numerosi articoli dello staff NCBI che riguardano le caratteristiche attuali e gli sviluppi futuri previsti per le banche dati NCBI, tra le quali CCDS, ClinVar, GenBank and RefSeq. Gli articoli sono anche presenti in PubMed.

07 dicembre 2017

Library Journal Club Networks - Risorse utili per Bibliotecari

Segnalo Library Journal Club Networks, un sito che contiene tutte le risorse informative utili per creare e condurre un Journal Club in biblioteca. Interessante anche il materiale per i Journal club segnalato nel sito London links, dove sono disponibili altri Trainers Toolkit per i bibliotecari formatori

Risorse per Systematic review e Meta-analysis

David Dillard il 30 novembre ha pubblicato nel suo blog Computer and Information Science Resources una collezione di risorse tematiche (bibliografia, siti web ecc.) riguardanti le systematic review e le meta-analisi

Tossicologia e Metodi Alternativi - AltTox.org

Il sito AltTox.org fornisce aggiornamenti sui metodi alternativi (in vitro e in silico methods)  per la sperimentazione in tossicologia (database, bibliografia, ecc.). E' possibile iscriversi alla mailing list e ricevere la loro e-Newsletter periodica: AltTox Digest ed essere informati su aggiornamenti e modifiche alle risorse

e-Learning for Healthcare - Tutorial "How to Search the Literature Effectively"

I colleghi inglesi hanno predisposto dei moduli di autoapprendimento (ognuno della durata di 20 minuti), corredati da questionario. Sono stati creati per gli utenti di area medica (clinica e non), con lo scopo di fornire concetti di base per la ricerca di informazioni e la creazione di stringhe di ricerca. Sono previsti 7 moduli, al momento ne sono stati pubblicati 3:
Module 1 Introduction to searching
Module 2 Where do I start searching?
Module 3 How do I start to develop a search strategy?

27 novembre 2017

La Nuova Beall's List of Predatory Journals and Publishers

Un post del 2 novembre di Bibliosan 2.0 annuncia la ricomparsa della Beall's list con un aggiornamento dei dati e dei contenuti (ricerca per singola rivista, ricerca per editore). E' anche presente un link al sito Think. Check. Submit.  La lista si conferma sempre uno strumento utile per i ricercatori, in particolare per coloro che scelgono di pubblicare in riviste open  access. Attenzione alle riviste che si occultano assumendo l'identità di un'altra rivista di qualità!

20 novembre 2017

La Black list dei Cibi più Pericolosi

Coldiretti stila una lista dei cibi più pericolosi basandosi sulle rilevazioni dell’ultimo rapporto della RASFF Sistema di allerta rapido europeo. Nello 2016 RASFF preliminari annual report, l'allarme riguarda i rischi alimentari nell'Unione europea causati da micotossine (in particolare aflatossine), metalli pesanti, inquinanti microbiologici ecc.

14 novembre 2017

PubMed - Guida alla Citazioni Bibliografiche

Nella ampia raccolta di ebook presenti nel sito NCBI Bookshelf è disponibile questo manuale con le istruzioni per creare bibliografie seguendo lo stile della NLM:
Citing Medicine: The NLM Style Guide for Authors, Editors, and Publishers [Internet]. 2nd edition. Patrias K, author; Wendling D, editor. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US); 2007-.
E' interessante perché sono contemplate tutte le fonti bibliografiche, che vengono analizzate in dettaglio facendo ricorso a molti esempi.

26 ottobre 2017

NLM ToxTutor e Introduction to Human Body

L'interessante tutorial ToxTutor della National Library of Medicine viene periodicamente aggiornato e arricchito di nuovi contenuti. Tra le novità,  Introduction to Human Body dello US National Cancer Institute con informazioni di anatomia e fisiologia, utile complemento per coloro che usano i database di chimica e tossicologia della NLM.

NLM - Suggerimenti per creare un Poster

Nel blog dello National Network of Libraries of Medicine Training Office (NTO) è possibile trovare suggerimenti utili (ai ricercatori ma anche ai bibliotecari) per la creazione di un poster,  che abbia come obiettivo la comunicazione scientifica

25 ottobre 2017

PubMed - Nuovi moduli interattivi di apprendimento

Tra i tutorial di PubMed sono presenti dei brevi moduli interattivi per l'apprendimento delle modalità di ricerca basilari. I moduli possono anche essere liberamente scaricati e inseriti nelle pagine web o nei moduli formativi per gli studenti.

11 ottobre 2017

Elsevier - ScienceDirect Topic Pages e Altre Risorse per i Ricercatori

Elsevier ScienceDirect Topics collega termini scientifici presenti negli articoli dei  periodici di ScienceDirect alle definizioni presenti nei libri pubblicati e ad altre informazioni correlate. Attualmente sono state create le pagine per: Biomedical Sciences, Neurosciences, Life Sciences.


Elsevier mette a disposizione dei ricercatori che si registrano il servizio ScienceDirect Personalized Recommender che invia per posta elettronica segnalazioni di articoli di interesse (relativi alla loro recente attività di ricerca bibliografica.

06 ottobre 2017

NLM Catalogue e Periodici di PubMed

Nel catalogo della NLM trovo anche informazioni sui periodici indicizzati in PubMed. Oltre alla scheda del periodico, con la sua storia posso verificare se viene indicizzato in modo completo (è un periodico dell'Index Medicus? I suoi record hanno i termini MeSH? Viene indicizzato completamente in PubMed e trovo solo alcuni articoli?).
Per verificare quali titoli vanno ad arricchire il database annualmente, controllo questa pagina. Posso anche verificare quali riviste vengono correntemente indicizzate

04 ottobre 2017

DOAB - Directory of Open Access Books

DOAB ha l'obiettivo di diffondere la conoscenza degli ebook Open Access, utili per le diverse discipline accademiche. Gli ebook sono accessibili a testo completo dal sito dell’editore o dall’archivio in cui sono depositati.

15 settembre 2017

PubMed - Posso identificare gli Autori che hanno dato uguale contributo ad una ricerca?

Novità in Pubmed! Nei record bibliografici è possibile verificare se vi sono degli autori che hanno contribuito equamente ad una ricerca. Se ci sono autori di "pari merito", nell'abstract del record di PubMed accanto ai nomi degli autori compare il simbolo # (come apice). Se poi si clicca sul link "Author information" vengono visualizzati gli autori che hanno contribuito alla pubblicazione e i loro indirizzi e in fondo all'elenco c'è la dicitura "# Contributed equally". Per informazioni dettagliate, consultare lo  NLM Technical Bulletin 2017 September-October No. 418

13 settembre 2017

World Health Organizazion IRIS - WHO global digital library

IRIS ( Institutional Repository for Information Sharing) è un punto di accesso per la ricerca, recupero e accesso online alle pubblicazioni e ai rapporti tecnici della Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS - WHO), consultabile in più lingue (inglese, francese, spagnolo, russo, cinese, arabo). La documentazione è full-text e le voci bibliografiche delle bibliografie sono linkate ad altre pubblicazioni dello WHO citate. L'aggiornamento è costante.
Tra gli ultimi documenti in IRIS trovo un interessante e aggiornato (2017) documento sugli additivi negli alimenti (con informazioni anche sul loro utilizzo nei cibi per i bambini)

Cataloguing-in-Publication data are available at http://apps.who.int/iris










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08 settembre 2017

Bibliotecari e Journal Club

Perché non chiedere di partecipare ai Journal Club organizzati dai gruppi di ricerca? Per i bibliotecari sarebbe uno strumento utile per capire gli interessi scientifici del proprio dipartimento. Lo suggerisce anche un articolo pubblicato nella rivista College & Research Libraries:
FITZGIBBONS, Megan; KLODA, Lorie; MILLER-NESBITT, Andrea. Exploring the Value of Academic Librarians’ Participation in Journal Clubs. College & Research Libraries, [S.l.], v. 78, n. 6, p. 774, aug. 2017. ISSN 2150-6701. doi:https://doi.org/10.5860/crl.78.6.774.

PubMed - Meta-ricerche e Systematic review

Per il recupero di record bibliografici in PubMed, focalizzati su metodologie di ricerca è possibile costruire la stringa di ricerca usando il filtro sysrev_methods[sb], ad esempio:
sysrev_methods[sb] AND "network meta-analysis"

Si parla ancora di Predatory Journals - Segnalazione articoli

Dalla lista di discussione dei bibliotecari americani ricavo la segnalazione di due articoli recenti:
- Il primo è un articolo comparso mercoledì nella rivista Nature, riguardante i predatory journals e che suggerisce anche un possibile ruolo di supporto dei bibliotecari nel contrastare questo fenomeno
Moher D, Shamseer L, Cobey KD, Lalu MM, Galipeau J, Avey MT, et al. Stop this waste of people, animals and money. Nature. 2017 Sep 6;549(7670):23-5.
- Il secondo articolo pubblicato il 29 agosto nel sito web Bloomberg Businessweek dal titolo Medical Journals Have a Fake News Problem riguarda le riviste OMICS e il loro fondatore. Queste riviste hanno avuto un forte sostegno da alcune compagnie farmaceutiche che vi pubblicano i loro lavori e partecipano ai convegni OMICS fornendo così credibilità e fondi al gruppo. L'articolo è accessibile gratuitamente.

NCBI Glycans - Nuovo sito web

NCBI Insights (post del 7 settembre) pubblica la notizia di questo nuovo sito web ricco di risorse per coloro che studiano struttura, biosintesi, biologia ed evoluzione dei glicani. Nel sito sono presenti varie risorse, la terza edizione del libro Essentials of Glycobiology  e di Symbol Nomenclature for Glycans (SNFG) oltre ad altri database e portali di interesse

20 luglio 2017

Early American Cookbooks - ebook di ricette e rimedi della HathiTrust


Il fascicolo n. 37 del 18 luglio della rivista Code4Lib presenta lo Early American Cookbooks digital project , un progetto che ha come obiettivo quello di rendere accessibile gratuitamente una collezione antica (1800-1920) di libri di ricette di cucina americane presenti nella collezione della HathiTrust Digital Library. Nei testi più antichi, oltre a essere presenti ricette che riguardano il cibo, sono contenuti anche rimedi medici casalinghi (inclusi quelli che utilizzano le piante). Se ad esempio si imposta una ricerca con i termini "recipes" "herbs" "medicine", i risultati sono interessanti!

Bibliometria - Eigenfactor: Tutto quello che vorreste sapere

Gli indicatori bibliometrici sono sempre materia di interesse per i bibliotecari e i ricercatori. Vi segnalo la pagina web che contiene le informazioni sul progetto Eigenfactor

12 luglio 2017

Come valutare le qualità di un sito medico - il Misurasiti del portale @Partecipasalute

Un articolo di Eugenio Santoro pubblicato in Negri News 174 di aprile 2017 suggerisce ai lettori 10 regole che possono aiutare a valutare i siti web e rinvia per ulteriori informazioni al portale @Partecipasalute , dove sono presenti informazioni sullo HON-code che è il codice di qualità che viene attribuito solo ai siti che hanno particolari requisiti. Per una veloce verifica della attendibilità e della qualità della fonte informativa che stiamo consultando è disponibile il Misurasiti di @Partecipasalute

NCBI - PubMed Journals

PubMed Journals è un nuovo servizio che permette di individuare le riviste più importanti indicizzate in PubMed, di cercare quelle di interesse e di essere aggiornati sui nuovi articoli pubblicati. Per usufruire di tutte le potenzialità e dei servizi del sito è necessario avere un account. Per coloro che utilizzano PubMed e hanno già un account  My NCBI è possibile utilizzare le stesse credenziali anche per questo servizio

06 luglio 2017

MeSH on Demand - Aggiornamento

La NLM annuncia che a breve saranno disponibili gli aggiornamenti di questo strumento per la ricerca dei termini del tesauro di PubMed utili per la composizione delle strategie di ricerca. Tutti i dettagli nell'articolo dello NLM Technical Bulletin n. 416, May-June 20, 2017

30 giugno 2017

Riviste dell'editore Elsevier - Journal Embargo Finder

Elsevier permette di cercare i suoi periodici e di verificare i periodi di embargo da rispettare per la pubblicazione negli archivi istituzionali con il suo nuovo: Journal embargo finder . Un elenco dei periodici e delle condizioni di embargo si può ottenere come file excel o pdf. Leggere attentamente le informazioni contenute nella pagina (in caso di dubbio consultare le istruzioni presenti nelle pagine del periodico di interesse) e le FAQ.

PubMed e Archivi Istituzionali di Ricerca

PubMed con il progetto Linkout rende visibili i record degli archivi istituzionali di ricerca. Per i dettagli leggere l'articolo pubblicato nel numero 415, marzo-aprile 2017, dello NLM Technical Bulletin. Come esempio guardate questo record  del database PubMed, c'è l'iconcina del repository (ma non sempre è presente) in alto a destra  nella schermata. Il collegamento all'archivio istituzionale per i partecipanti al progetto è sempre presente sotto l'abstract del record, cliccando su Linkout- more resources e sul link di Other Literature Sources .


Come indicato dall'articolo, le istruzioni per aderire a Linkout sono contenute nella pagina dedicata, dove trovate anche l'elenco dei partecipanti

29 giugno 2017

Fumetti e Ricerca Medica

Il Centre of Molecular Parasitology dell'Università di Glasgow presenta la sua attività di ricerca servendosi di fumetti e illustra il progetto nel suo blog. L'ultimo fumetto pubblicato riguarda la Toxoplasmosi. Questa interessante iniziativa che ha intenti divulgativi di avvale di un ottima grafica e di contenuti rigorosi.
Ai bibliotecari interessati alle applicazioni della grafica nella loro disciplina segnalo il blog The Graphic Librarian di Matthew N. Noe.

15 giugno 2017

Primi passi nell'universo dei "Research Data" per i bibliotecari

Segnalo un bellissimo ed interessante articolo destinato ai bibliotecari che "muovono i primi passi" nell' universo dei "Research data":
 BARBROW, Sarah; BRUSH, Denise; GOLDMAN, Julie. Research data management and services: Resources for novice data librarians. College & Research Libraries News, [S.l.], v. 78, n. 5, p. 274, may 2017. ISSN 2150-6698. Available at: <http://crln.acrl.org/index.php/crlnews/article/view/16660/18116>. Date accessed: 15 june 2017. doi:https://doi.org/10.5860/crln.78.5.274.


Imperdibile il neonato sito web NNLM RD3: Resources for Data-Driven Discovery del National Network of Libraries of Medicine

31 maggio 2017

NCBI Tutorials e Webinars

In NCBI YouTube channel è possibile vedere dei tutorial e webinar per le risorse della NCBI e della NLM. Consultare la pagina Webinars & courses dove sono presenti gli eventi di quest'anno (inclusi quelli già programmati) e il materiale archiviato (sono presenti anche video completi di didascalie). Il materiale è molto utile anche per i formatori!

19 maggio 2017

MEDLINE/PubMed - Numero di Citazioni per i Nomi degli Autori

E' possibile vedere le statistiche (e i grafici) per gli autori presenti nei record del database e il link ad un'altra pagina con le strategie di ricerca per i nomi di autori, collaboratori e gruppi. Le statistiche sono tratte dal report 2017

11 maggio 2017

NLM Learning Resources Databases - Nuova pagina web per la formazione

Il sito Learning Resources Database raccoglie tutto il materiale utile per la formazione creato dalla National Library of Medicine. Sono inclusi: video, tutorial, webinar,e altre risorse utili per la formazione  su prodotti e servizi della National Library of Medicine , inclusi PubMed, PubMed Central, MEDLINE, e altri ancora.

03 maggio 2017

27 aprile 2017

The New Genetics - NIH manuale

Il National Institute of  General Medical Sciences (NIGMS) presenta The New Genetics, un manuale utile per un'introduzione alle conoscenze di base nel campo della genetica. Il libro è disponibile in formato   e pdf. Lo NIGMS mette a disposizione  una collezione di altri manualetti divulgativi (discipline: cell biology, genetics, chemistry, structural biology, computational biology and pharmacology)

20 aprile 2017

PrePubMed - Uno strumento di ricerca di articoli in formato preprint

PrePubMed recupera articoli dai server di Preprint: arXiv q-bio, PeerJ Preprints, bioRxiv, Nature Precedings, e articoli presenti in F1000Research and Wellcome Open Research , sottoposti a post-publication peer review e articoli free da The Winnower.
L'aggiornamento è giornaliero.
Un post pubblicato il 19 aprile nel blog The Scholarly Kitchen evidenzia la necessità di una definizione chiara e condivisa del termine "preprint" e  di quelli che vengono definiti "Preprint server".

Medical Genetics Summaries - NLM ebook

Medical Genetics Summaries è una raccolta continuamente aggiornata di articoli che trattano dell'impatto delle variazioni genetiche sulla salute umana. Vengono analizzate specifiche malattie e i rapporti tra varianti genetiche e risposte ai farmaci. E' anche possibile scaricare il formato pdf  e utilizzare i contenuti citando in modo appropriato la fonte:
Pratt V, McLeod H, Dean L, et al., editors. Medical Genetics Summaries [Internet]. Bethesda (MD): National Center for Biotechnology Information (US); 2012-.  Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK61999/



18 aprile 2017

Collezioni Digitali della NLM: Digitalizzazione di Ricettari

La NLM continua la digitalizzazione del suo immenso patrimonio antico. Attualmente sta digitalizzando delle monografie manoscritte, prodotte per lo più da donne, nei secoli 1600-1900. Leggere qui l'annuncio.

Per una ricerca più generale sui ricettari nel sito della NLM Digital Collections, digitate la stringa: recipe OR receipt , il risultato è sorprendente!

Beall's List dei "Predatory Open Access Publishers"

La lista dopo la sua chiusura è stata archiviata, come potrete vedere è "congelata" alla data del 3 gennaio 2017.

22 marzo 2017

Pubblicazioni Open Access - Come le controllo?

Come verifico la disponibilità open access di un elenco di pubblicazioni (libri, periodici, dati ecc.)? Se ho il numero DOI di un articolo, il percorso più veloce ed efficace  è usare oaDOI (vedi precedente post in questo blog o in Bibliosan 2.0): faccio un copia/incolla del numero DOI nella stringa di ricerca e il motore mi indica il tipo di rivista (Gold o Green OA) e il tipo di licenza.  Vedere anche l'analisi ("pros" e "cons") di Clayton Hayes nel post del blog Scholars Cooperative.
Un altra possibilità è lo Open Access Button che permette di cercare con il DOI, il PMID o l'url di un articolo.
Se cerco i metadati di un articolo (incluso il numero DOI) o di un  libro o di una raccolta di dati posso usare Crossref.
Il blog Scholars Cooperative presenta un altro strumento di Impactstory (il creatore di oaDOI): Unpaywall. E' un'estensione per Chrome e Firefox alla quale attualmente si viene reindirizzati se ci si collega oaDOI e che  permette subito di controllare dalla pagina di un articolo, la disponibilità di una versione OA (icone di colore diverso indicano diverse tipologie di accesso) .

20 marzo 2017

Reviewer CREDITS - Dove Registrare l'Attivita' di Peer Review?

Reviewer Credits è un nuovo sito italiano nato dall'iniziativa di due ricercatori medici, docenti dell'Università di Milano-Bicocca. La sua creazione risponde alla necessità di vedere riconosciuta l'attività di peer review, che i ricercatori svolgono gratuitamente.
Le attività dei revisori vengono "validate" dagli editori delle riviste, al fine di riconoscere loro un certo numero di crediti.
Nel sito indicato trovate tutte le informazioni sull'iniziativa, l'elenco dei partecipanti e degli editori. E naturalmente le istruzioni per la registrazione!

Research Stash - Ancora Risorse per i Ricercatori in Bibliosan 2.0

Un post del 16 marzo in Bibliosan 2.0 segnala ancora un sito con strumenti e risorse utili per i ricercatori, si chiama Research Stash

Nuovo Database - DrugAge

DrugAge è un nuovo database ad accesso gratuito presente assieme ad altre risorse (gratuite) nel sito Human Aging Genomic Resources (HAGR). Contiene informazioni su farmaci, composti e supplementi nutrizionali (inclusi nutraceutici e prodotti naturali) con proprietà anti-invecchiamento che prolungano la vita nei modelli sperimentali (utile anche per le differenze di gender)
Trovate le informazioni nell'annuncio
http://genomics.senescence.info/drugs/index.php
e tutti i dettagli in un articolo pubblicato nella rivista open access Aging cell
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/acel.12585/epdf

QS TopUniversities - Graduatoria delle Università nel Mondo

Nel sito QS TopUniversities è possibile vedere quali sono le università più prestigiose nel mondo e compararle anche per disciplina. Potete cercare anche la nostra Università, vedere la sua posizione a livello mondiale, verificare la posizione nelle varie discipline e fare comparazioni con  altre università.

07 marzo 2017

28 febbraio 2017

PubMed e le Basi Dati NCBI

Potete trovare la descrizione e le carateristiche delle basi dati NCBI accessibili da PubMed nel seguente ebook:
The NCBI Handbook [Internet]. 2nd edition. Bethesda (MD): National Center for Biotechnology Information (US); 2013-.

27 febbraio 2017

SharedIt - Strumento per Ricercatori

Springer Nature mette a disposizione dei ricercatori SharedIt, uno strumento per condividere gli articoli di interesse con i colleghi e in generale con la comunità scientitifica. In fondo alla pagina trovate le istruzioni (anche per i bibliotecari). L'iniziativa permetterà all'editore di monitorare l'attività dei ricercatori sulle pubblicazioni.

101 Innovations in Scholarly Communication - Come Gestire i Flussi Informativi nella Ricerca?

E' un sito che illustra gli strumenti e le piattaforme più importanti a supporto dell'attività dei ricercatori. Gli autori indicano anche un ulteriore link ad un file che raccoglie ed elenca ulteriori strumenti (più di 400). Il sito è parte di un progetto più ampio: Innovation in Scholarly Communication
E i bibliotecari cosa possono fare in questo universo informativo sempre più  complesso? Leggetevi il post di Keith Webster pubblicato nel blog LSE-The Impact Blog, post dal quale sono tratte tutte le informazioni indicate qui sopra.

06 febbraio 2017

OMS/WHO Pubblica le Nuove Linee Guida sul Cancro

L'Organizzazione Mondiale della Sanità pubblica le nuove linee guida "Guide to cancer early diagnosis" ed evidenzia l'importanza della prevenzione e della diagnosi precoce. Leggete qui la presentazione della guida.

02 febbraio 2017

PubMed Tools per Ricercatori e Dottorandi - JANE Journal/Author Name Estimator e Altri Strumenti

Hai scritto un articolo scientifico ma non sai a quale rivista inviarlo? Vuoi trovare articoli da citare nella tua bibliografia? Sei un editore e vuoi trovar un revisore per un particolare articolo? Puoi usare JANE che ti permetterà di comparare il tuo articolo con milioni di articoli contenuti in Medline e trovare una risposta a questi quesiti.
Non dimenticare altri strumenti utili come ad es. PubReMiner con analoghe caratteristiche. MeSH on Demand è invece utile per cercare i termini MeSH più adatti a descrivere il contenuto del proprio articolo, nonché per recuperare gli articoli correlati (inserire una parte di testo nella finestra di ricerca)

PubMed PubReMiner - Nuovo Strumento per la Ricerca in PubMed

PubReMiner permette di digitare i termini che vanno a comporre una stringa di ricerca in PubMed e di ottenere i risultati strutturati e visualizzati in forma di tabelle di frequenza (Year, Journal, Author, Word, MeSH, Substances, publication type, Country), i cui termini (che si presentano come delle "keyword" cliccabili) possono essere aggiunti o esclusi dalla stinga di ricerca per ottimizzare i risultati. Inoltre PubReMiner può essere utile anche per altri scopi: verificare quali sono le riviste più usate in un determinato ambito di ricerca ed eventualmente in quali pubblicare, quali sono gli esperti di un determinato settore disciplinari e l'ambito di ricerca di uno specifico ricercatore (analizzando le keywords associate ai suoi lavori)

01 febbraio 2017

JournalTOC's - The Latest journal Tables of Contents

Una risorsa gratuita per coloro che vogliono essere aggiornati sui contenuti delle loro riviste scientifiche preferite. JournalTOC's permette di usare parole chiave per la ricerca e di salvarle assieme agli indici dei fascicoli e ricevere gli aggiornamenti via email.

PubMed - Novità in arrivo!

Sono previste novità (prossimamente) per l'algoritmo che consente di visualizzare i dati con l'opzione "Sort  by: Best match", che sarà più performante e potente. Inoltre nella schermata di visualizzazione dei risultati, la finestra "Search details" verrà rinominata "Best match search information" e mostrerà come i termini liberi da noi usati nella ricerca vengono convertiti in termini Mesh ecc.,  il link "See more..." ci permetterà di vedere altri sinonimi usati dall'algoritmo di ricerca. Per ulteriori informazioni leggere la notizia nell'ultimo NLM Technical Bulletin

Genome Informatics 2016 - Articolo ad Accesso Libero di Genome Biology 2017

L' articolo "Genome informatics 2016" di Davide Chicco e Michael M. Hoffman pubblicato il 16 gennaio 2017 nella rivista Open Access Genome Biology riassume le novità nel campo della genomica computazionale (metodi, strumenti, sistemi, tecnologie, piattaforme e archivi condivisi di dati), emerse nella conferenza omonima tenutasi a Hinxton, in Inghilterra a settembre 2016. Tra le risorse citate CIViC, Clinical Interpretation of Variants in Cancer una risorsa web open access, open source, che raccoglie ed analizza  raccolte di dati sulle mutazioni collegate alle varie forme di cancro. Viene gestita dalla comunità di ricercatori che vi aderisce con la supervisione di un "Domain Experts" che promuove e mantiene la qualità dei risultati.  Ne parla anche un articolo appena pubblicato in Nature Genetics e una notizia diffusa dal servizio informativo Med Xpress

31 gennaio 2017

Scrivere un Articolo Scientifico - Come Gestire il "Blocco dello Scrittore"

Se davanti al foglio o al computer vi sentite incapaci di scrivere (o digitare) una sola parola, non preoccupatevi qualcuno già nel 1974 ha avuto l'idea di pubblicare un articolo di godibilissima lettura:
Upper D. The unsuccessful self-treatment of a case of "writer's block". J Appl Behav Anal. 1974 Fall;7(3):497. PubMed PMID: 16795475; PubMed Central PMCID: PMC1311997
che ha ricevuto n. 3 citazioni in PubMed, n. 51 in Google Scholar  e n. 13 in Web of Science.
Possiamo considerare questo articolo una "Sleeping Beauty"  che ha dato un contributo fondamentale ad un tema sempre attuale?

23 gennaio 2017

Le Radio nel Mondo - Sito per il Tempo Libero

The Scout Report segnala Radio Garden un sito che consente di collegarsi a 8000 radio nel mondo. Radio Garden che utilizza tecnologie open source è stato realizzato da Jonathan Puckey con il supporto finanziario del Netherlands Institute of Sound and Vision. Tutti i dettagli nel numero del 20 Gennaio 2017:
Internet Scout Research Group. (2017, January 20). "The Scout Report -- Volume 23, Number 3." Retrieved from https://scout.wisc.edu/report/2017/0120

Biblioteca Vaticana - Progetto di Digitalizzazione delle Collezioni

Per avere notizie sull'attività in corso presso la Biblioteca Vaticana collegarsi al sito e cercare le collezioni  di DigitVatLib

Infermieri ed Operatori della Salute - Bibliografie, Spogli, Siti Utili

La Commission Écoles Paramédicales del portale francese Ascodocpsy propone delle bibliografie tematiche con articoli e spogli da riviste in lingua francese, dossier, pubblicazioni e siti web di interesse. Molte risorse sono di libero accesso. Nel portale è presente ance la base dati Base SantéPsy

12 gennaio 2017

Convertire File di Testo in Excel

Researchbuzz del 10 gennaio, segnala un articolo di Saikat Basu pubblicato in MUO (MakeUseOf) riguardante le procedure da seguire per convertire file di testo in Excel.

20 dicembre 2016

Bibliotecari scientifici ma non solo - Alcuni Blog e Portali utili

Segnalo il blog e-Science Community Blog, dove trovate notizie anche sugli articoli pubblicati nella rivista Journal of eScience Librarianship , e  il portale e-Science Portal for Librarians . Nel portale troviamo anche la segnalazione di blog utili, in particolare per chi si occupa di "Data management"

Bibliografia: Come citare un software

Può capitare di dover citare in bibliografia un software utilizzato per la propria ricerca, non è ancora una pratica molto usuale e può essere utile la lettura di un interessante articolo peer-reviewed di Laura Soito e Lorraine J. Hwang, dal titolo "Citations for Software: Providing Identification, Access and Recognition for Research Software" appena pubblicato nella rivista International Journal of Digital Curation 2016, Vol. 11, Iss. 2, 48–63 DOI: 10.2218/ijdc.v11i2.390

14 dicembre 2016

Bibliotecari: Blog e Articoli di Interesse

Segnalo il blog The Library Lab di Christian Lauersen, si parla dell'evoluzione della nostra professione verso nuovi ruoli e si evidenzia sempre di più come la formazione si un concetto chiave e imprescindibile. Se ne parla anche nel post "The research librarian of the future: data scientist and co-investigator" pubblicato in LSE The Impact Blog, dove viene sottolineata (in prospettiva futura) l'importanza del ruolo del bibliotecario come supporto alla ricerca.





















Hashtag e Informazioni

Nel blog Bibliosan 2.0  del 12 dicembre, un post ci informa della nascita di archivi per i messaggi di Twitter che riguardano informazioni del campo medico e scientifico, ne vengono citati due: Symplur e SciHashtag

01 dicembre 2016

Suggerimenti per Creare una "Pessima Presentazione" ovvero Fare l'Esatto Contrario!

Nel blog Retraction Watch è presente un post utile e divertente "18 tips for giving a horrible presentation", che recensisce un video "The Secrets of Memorably Bad Presentations" di David Scholl, Georgia Institute of Technology. Leggere anche i commenti! Quanti sono riusciti a non cadere in almeno uno dei 18 punti critici?