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18 luglio 2019

DrugBank - Banca dati gratuita canadese per i farmaci

DrugBank è una banca dati fattuale gratuita canadese che fornisce informazioni dettagliate sui farmaci (chimiche, farmacologiche e farmaceutiche) assieme a informazioni sui loro target (sequenze, strutture ecc.). Il database contiene schede informative riguardanti più farmaci, tra i quali i farmaci biotech approvati dalla FDA, neutraceutici e farmaci sperimentali, sono anche presenti le sequenze di proteine (cioè drug target) che sono linkate ai farmaci stessi. Le informazioni rinviano ai contenuti di altre basi dati (ClinicalTrials.gov, PubChem, PharmaGKB, Chemspider ecc.).
DrugBank risponde alle esigenze informative di ditte farmaceutiche, chimici farmaceutici, farmacisti, farmacologici, medici e anche del pubblico in generale. Per essere informati sulle novità inserite nel database, collegarsi al blog

11 luglio 2019

Transpose - Accesso alle Politiche Editoriali delle Riviste Scientifiche

Un post del 26 giugno di Bibliosan 2.0 segnala la nascita di Transpose, una nuova banca dati online che consente di accedere alle politiche editoriali delle riviste scientifiche. E' utile per i ricercatori che vogliono scegliere tra le riviste quella più adatta per pubblicare i loro articoli. E' possibile anche il confronto tra più riviste.

14 maggio 2019

TRIP Database - Mappe dell'evidenza

Trip (Turning Research into Practice) è un metamotore gratuito per la ricerca di informazioni cliniche di evidence-based medicine. Ha recentemente elaborato delle "evidence maps" che visualizzano tutte le informazioni conosciute su un argomento (es. emicrania). Le mappe comparano tutte le alternative terapeutiche (sulla base delle informazioni disponibili). Indicano l'efficacia di ogni trattamento e il "grado di evidenza" dello stesso (ci sono link ai record in PubMed). 
Le dynamic knowledge maps sono una possibile alternativa alle "literature review" anche in ambiti disciplinari diversi dalla medicina?

03 maggio 2017

28 febbraio 2017

PubMed e le Basi Dati NCBI

Potete trovare la descrizione e le carateristiche delle basi dati NCBI accessibili da PubMed nel seguente ebook:
The NCBI Handbook [Internet]. 2nd edition. Bethesda (MD): National Center for Biotechnology Information (US); 2013-.

01 febbraio 2017

Genome Informatics 2016 - Articolo ad Accesso Libero di Genome Biology 2017

L' articolo "Genome informatics 2016" di Davide Chicco e Michael M. Hoffman pubblicato il 16 gennaio 2017 nella rivista Open Access Genome Biology riassume le novità nel campo della genomica computazionale (metodi, strumenti, sistemi, tecnologie, piattaforme e archivi condivisi di dati), emerse nella conferenza omonima tenutasi a Hinxton, in Inghilterra a settembre 2016. Tra le risorse citate CIViC, Clinical Interpretation of Variants in Cancer una risorsa web open access, open source, che raccoglie ed analizza  raccolte di dati sulle mutazioni collegate alle varie forme di cancro. Viene gestita dalla comunità di ricercatori che vi aderisce con la supervisione di un "Domain Experts" che promuove e mantiene la qualità dei risultati.  Ne parla anche un articolo appena pubblicato in Nature Genetics e una notizia diffusa dal servizio informativo Med Xpress

29 settembre 2016

PubMed - Aggiornamenti

Come segnala PubMed gli articoli con errata, duplicazioni, articoli corretti e ripubblicati,  ecc.?  I dettagli in questa pagina della NLM.
In quali campi dei record MEDLINE sono contenute queste informazioni? Consultate questa guida

19 aprile 2016

Articoli di Interesse - Le Basi dati della NCBI e le Basi Dati per la Biologia Molecolare: Aggiornamenti e Prospettive Future

Nella rivista Nucleic Acids Research Database, 23ma edizione annuale, sono presenti alcuni articoli Open Access che riguardano i database della NCBI (GenBank, Refseq, clinVar, PubChem ecc.) e il loro futuro sviluppo. Li trovate riassunti in questa pagina e li potete anche leggere partendo dai record di PubMed.  Nel medesimo fascicolo della rivista Nucleic Acids Research: Database issue, vol. 14, Issue D1, 04 January 2016, sono contenuti numerosi articoli che analizzano i database di biologia molecolare e ne illustrano gli aggiornamenti.













29 febbraio 2016

National Center for Biotechnology Information - Tutte le Risorse per la Biomedicina e la Genomica

National Center for Biotechnology Information (NCBI) nella sua pagina web presenta  tutte le sue risorse gratuite per i ricercatori che si interessano di biomedicina e genomica. E' possibile fare una ricerca su tutti i database (global research) o su una selezione di essi . Tra le novità una raccolta di informazioni su Zika che sono state aggiunte al database NCBI Virus Variation  dove è presente il nuovo modulo Zika Virus Resource

09 febbraio 2016

MedPix - Database Gratuito di Immagini Mediche

La National Library of Medicine annuncia il lancio di MedPix®, un database gratuito di immagini, originariamente sviluppato dai "Departments of Radiology and Biomedical Informatics at the Uniformed Services University, Bethesda, Maryland, USA".  MedPix integra immagini e testo ed è una risorsa utile a medici, studenti di medicina, infermieri e studenti di infermieristica. I contenuti sono organizzati per localizzazione della malattia a livello di organo, per patologia, per profili del paziente e per classificazione delle immagini.

12 gennaio 2016

PubMed - Strategie di Ricerca e Suggerimenti dai Blog

Il blog PubMed Search Strategies è nato nel 2009 per condividere le strategie di ricerca. Se avete dubbi nel creare la vostra stringa di ricerca, potete verificare se qualcuno trovandosi nella stessa situazione ha trovato una soluzione e trarne dei suggerimenti.
Provate ad esempio a cercare tutti i post che hanno l'etichetta: drug (potete trovare anche dei suggerimenti per Embase da usare nella base dati Scopus).
Interessante anche il progetto di condivisione delle strategie di ricerca in PubMed del sistema bibliotecario dell'Università di Pittsburgh, con la creazione del database per bibliotecari: MedTerm Search Assist
Sempre per PubMed, vedere il blog della Hardin Library for the Health Sciences

Risorse della NCBI: Corsi e Webinars

Per imparare velocemente ad utilizzare i database e le risorse della NBCI sono molto utili  i webinar e i corsi che vengono periodicamente organizzati dalla NCBI e dalla NLM. Li trovate tutti in questa pagina, assieme ai materiali presentati incluse le esercitazioni e le slide.

17 luglio 2015

ChemIDPlus di TOXNET: Novità

L'interfaccia del database è stata potenziata, leggete qui tutte le novità!

19 giugno 2015

PubMed e gli "Altri Abstract"

I bibliotecari biomedici americani segnalano una curiosità di PubMed. Alcuni record che non hanno abstract possono avere degli "abstract alternativi", che possono essere stati scritti dopo la pubblicazione dell'articolo o da altri partner. In questo caso l'abstract è presente nel campo del record di PubMed contrassegnato dall'etichetta OAB. Questo campo del record è visibile solo se il record viene visualizzato nel formato (Format): MEDLINE oppure Abstract (text). Per saperne di più leggere la guida e non abbandonare le speranze difronte a un record senza riassunto...

18 febbraio 2015

Tossicologia - Siti Utili

Vi segnalo questo ebook di tossicologia ad accesso gratuito
http://www.toxipedia.org/display/hwt/A+Small+Dose+of+Toxicology%2C+2nd+Edition

e la base dati bibliografica SafetyLit
http://www.safetylit.org/index.htm

"... this database "provides abstracts of reports from researchers who work in the more than 30 professional disciplines relevant to preventing unintentional injuries, violence, and self-harm. Among these are anthropology, economics, education, engineering specialties, ergonomics and human factors, health and medicine, law and law enforcement, psychology, sociology, and other fields. SafetyLit staff and volunteers regularly hand-examine (issue by issue) more than 3400 current scholarly journals from many nations to find relevant material. This information is maintained in a searchable database that contains more than 225 thousand items. The database contains articles from 4405 journals that are not included in PubMed/Medline." ..."

E' una delle risorse gratuite utili per la tossicologia segnalate nella pagina web della Sheldon Margen Public Health Library (Univ. of California, Berkeley Library)http://www.lib.berkeley.edu/PUBL/tox.html
       

20 gennaio 2015

EuroStemCell e il database StemDB

EuroStemCell nasce da un progetto della Comunità Europea e raccoglie informazioni e risorse diverse riguardanti la ricerca sulle cellule staminali  (in 6 lingue diverse). Ospita il database StemDB.

ETHICSWEB - Un portale per le Scienze Biomediche

Ethicsweb è un portale europeo che raccoglie e rende accessibili informazioni sull'etica nelle scienze. I dati provengono da risorse diverse: basi dati (incluso Pubmed), leggi, regolamenti, materiale di ricerca, materiale didattico ecc.

23 ottobre 2014

Farmaci in Gravidanza e Allattamento

Farmaci e gravidanza è il nuovo sito dell'AIFA dedicato alle informazioni sull'uso dei farmaci in gravidanza ed allattamento.

La base dati LactMed (National Library of Medicine) ha rinnovato la sua pagina web. Lactmed viene aggiornata mensilmente, contiene informazioni (peer-reviewed) tratte dalle pubblicazioni scientifiche. Può essere interrogata sia singolarmente che assieme alle altre basi dati presenti nel portale TOXNET.

EUROETHICS - The European Bibliographic Literature Database

The European bibliographic literature database EUROETHICS è una base dati bibliografica per la medicina etica e l'etica biomedica

06 giugno 2014

Scopus - Le Novità in un Blog

Per essere sempre informati sulle novità e le implementazioni di Scopus, è molto utile consultare il suo blog! Tra le novità, una nuova pagina per il profilo degli autori.