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24 maggio 2019

Data Discovery in PMC and PubMed - Video della NLM

Negli ultimi due anni, la National Library of Medicine (NLM) ha condotto un'analisi dei metodi più efficienti per creare dei link tra le fonti bibliografiche e gli archivi di dati associati. Una notizia apparsa il 23 maggio nello NLM Technical Bulletin segnala un video di 9 minuti sui Data Discovery in PMC e PubMed. Nel video vengono presentate le novità e i anticipati i progetti futuri.

13 febbraio 2018

Articolo di interesse: Medical Preprints—A Debate Worth Having, The JAMA Network

A proposito di archivi di archivi di preprint e dati della ricerca, segnalo questo articolo apparso nella rivista JAMA
Maslove DM. Medical Preprints—A Debate Worth Having. JAMA. 2018;319(5):443–444. doi:10.1001/jama.2017.17566
La prevista nascita dell'archivio MedArXiv suggerisce all'autore dell'articolo alcune interessanti riflessioni sulle potenziali conseguenze dell'archiviazione dei dati preliminari della ricerca medica clinica.


Sempre a proposito di preprint, un altro articolo in JAMA evidenzia che le pubblicazioni archiviate come preprint prima di comparire nella rivista come articoli pubblicati ricevono punteggi di Altmetrics maggiori rispetto alle pubblicazioni che non sono presenti negli archivi di preprint
Serghiou S, Ioannidis JPA. Altmetric Scores, Citations, and Publication of Studies Posted as Preprints. JAMA. 2018;319(4):402–404. doi:10.1001/jama.2017.21168

01 febbraio 2017

Genome Informatics 2016 - Articolo ad Accesso Libero di Genome Biology 2017

L' articolo "Genome informatics 2016" di Davide Chicco e Michael M. Hoffman pubblicato il 16 gennaio 2017 nella rivista Open Access Genome Biology riassume le novità nel campo della genomica computazionale (metodi, strumenti, sistemi, tecnologie, piattaforme e archivi condivisi di dati), emerse nella conferenza omonima tenutasi a Hinxton, in Inghilterra a settembre 2016. Tra le risorse citate CIViC, Clinical Interpretation of Variants in Cancer una risorsa web open access, open source, che raccoglie ed analizza  raccolte di dati sulle mutazioni collegate alle varie forme di cancro. Viene gestita dalla comunità di ricercatori che vi aderisce con la supervisione di un "Domain Experts" che promuove e mantiene la qualità dei risultati.  Ne parla anche un articolo appena pubblicato in Nature Genetics e una notizia diffusa dal servizio informativo Med Xpress