Il Web che si Perde - Articolo di Eugenio Cau

Sabato 21 novembre, Il Foglio Quotidiano ha pubblicato questo interessante articolo di Eugenio Cau., un'interessante analisi della fragilità delle informazioni in Internet e la fine dell'illusione Internet che sia una biblioteca infinita.

Articoli di Interesse - Come selezionare le parole chiave e aumentare l'impatto degli articoli

E' stato pubblicato un interessante articolo che analizza come le "keyword" degli articoli scientifici siano importanti nel recupero degli stessi e la ricaduta (impatto) nell'indagine bibliometrica. Quando la rivista  non propone una lista di parole chiave da utilizzare, come si comportano i ricercatori? Nell'editoriale si suggerisce di usare i termini del tesauro MeSH di PubMed per migliorare il recupero delle informazioni in MEDLINE, ma di aggiugere termini e frasi che, anche se non presenti nel MeSH, vengono adottati dalla comunità scientifica di riferimento. Quest'ultima pratica favorisce il recupero degli articoli con i motori di ricerca e da altri archivi.
Ecco l'articolo:
Bekhuis, T. (2015). Keywords, discoverability, and impact. Journal of the Medical Library Association : JMLA, 103(3), 119–120. http://doi.org/10.3163/1536-5050.103.3.002

Prodotti per la Casa e Tossicità per gli Animali

Molti prodotti che utilizziamo in casa o le piante che la arredano possono essere tossici per i nostri animali domestici. Nel sito americano APSCA potete trovare informazioni utili.
Un'importante risorsa informativa per la tossicologia è TOXNET  il portale che contiene database bibliografici e fattuali (documenti completi).

Risorse per i Ricercatori

Segnalazioni interessanti del blog Bibliosan 2.0:
Come selezionare le riviste più adatte per pubblicare i propri lavori? Una guida utile ai giovani ricercatori nel sito web Think.Check.Submit.
Pubblicare su una rivista Open Access, ma qual è il "grado di apertura" di una rivista? E' disponibile una breve guida creata da SPARC e PloS.

PubMed: MeSH 2016

E' disponibile l'elenco dei nuovi termini introdotti nel MeSH 2016, dei descrittori modificati, di quelli cancellati.

Novità in PubMed e Attività previste a fine anno

I titoli di articoli stranieri non tradotti in inglese non erano visibili in PubMed, nel campo titolo del record compariva l'informazione [Not Available]. Da settembre per questi record nel campo titolo, compare il titolo in lingua originale.
Durante la ricerca non è però possibile cercare il titolo originale nel campo titolo [ti], bisogna impostare la ricerca usando il campo:
Transliterated/Vernacular Title field tag [tt]
esempio: thrombocytoses [tt]
Per i dettagli, leggere qui


Attenzione alle notizie pubblicate  dal blog NCBI Insights, tra queste la nascita del nuovo PubMed Labs, luogo di scambio di idee e di presentazione di prodotti innovativi per i ricercatori.
Vi si trova la notizia che vi è la  possibilità di vedere gli articoli più letti dagli utilizzatori del database.  In alcuni abstract alla voce "Related Information" è presente un link "Articles frequently viewed together".
Se vogliono cercare tutti questi articoli,  è  possibile inserire in PubMed la stringa di ricerca:
“pubmed_pubmed_alsoviewed[filter]”


Attività previste a fine 2015:
Dal 18 Novembre, la NLM sospenderà temporaneamente l'inserimento dei record completamente indicizzati (quelli con etichetta MEDLINE) in PubMed.
A metà Dicembre, i record MEDLINE e il database MeSH verranno aggiornati con il MeSH 2016.

NLM Citing Medicine ebook

Se avete dubbi nel compilare una bibliografia troverete utile questa pubblicazione gratuita con le indicazioni della NLM. La pubblicazione è stata recentemente aggiornata (vedere in contenuti in Appendice) ed è possibile scaricarla in formato pdf. Anche i bibliotecari biomedici potranno trovarvi delle informazioni utili .
A proposito, questo ebook si cita così in bibliografia:
Patrias K. Citing medicine: the NLM style guide for authors, editors, and publishers [Internet]. 2nd ed. Wendling DL, technical editor. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US); 2007 -    [updated 2015 Aug 11; cited Year Month Day]. Available from: http://www.nlm.nih.gov/citingmedicine

Articolo di PLOS One sul Mercato dell'Editoria Scientifica

Ancora un post di Bibliosan 2.0 pubblicato il 17 giugno 2015 e riguardante un articolo di PLOS One sugli editori di ambito scientifico e il "oligopolio" delle riviste scientifiche:
Larivière V, Haustein S, Mongeon P (2015) The Oligopoly of Academic Publishers in the Digital Era. PLoS ONE 10(6): e0127502. doi:10.1371/journal.pone.0127502
nello stesso articolo anche l'analisi dell'impatto citazionale delle migrazioni dei periodici dai piccoli ai grandi editori.

Bibliometria: Rapporto sugli Indicatori Bibliometrici dell'Ente Inglese HEFCE

Bibliosan 2.0 con un post del 17 luglio segnala la pubblicazione di un rapporto sull'utilizzo degli indicatori bibliometrici per la valutazione della ricerca scientifica.
Il rapporto è frutto dell'attività dell'ente inglese Higher Education Founding Council for England (HEFCE):
Wilsdon, J., et al. (2015). The Metric Tide: Report of the Independent Review of the Role of Metrics in Research Assessment and Management. DOI: 10.13140/RG.2.1.4929.1363. Da non perdere, così come la bibliografia allegata:
Wouters, P. et al. (2015). The Metric Tide: Literature Review (Supplementary Report I to the Independent Review of the Role of Metrics in Research Assessment and Management). HEFCE. DOI: 10.13140/RG.2.1.5066.3520
e il sito web Responsible Metrics segnalato!

ChemIDPlus di TOXNET: Novità

L'interfaccia del database è stata potenziata, leggete qui tutte le novità!

Nuovi Libri Antichi Digitalizzati dalla National Library of Medicine

Questa settimana la NLM annuncia che ha sottoscritto una collaborazione triennale con l'Università di St. Andrews e la partecipazione al catalogo della British Library:  English Short Title Catalog (ESTC). I testi antichi già digitalizzati dalla NLM sono 200.
L'Università di St. Andrews ospita lo Universal Short Title Catalog (USTC), fondato dalla Andrew J. Mellon Foundation. USTC è un catalogo collettivo che include tutti i libri pubblicati in Europa, dalla nascita della stampa fino al sedicesimo secolo.

Bibliotecari: Articoli di interesse

La "Monographic Section" del fascicolo di Giugno del volume 11 della rivista Journal of  EAHIL è dedicata all'analisi dell'uso di dispositivi mobili e di nuove tecnologie nelle biblioteche mediche europee.

Il Processo di Pubblicazione: Guide per Giovani Ricercatori e Dottorandi

Nel sito editage Insights che fornisce servizi a pagamento, alla voce Publication process sono disponibili informazioni gratuite, utili ai ricercatori per risolvere dubbi riguardanti il processo e le fasi di pubblicazione di un articolo. Le informazioni, liberamente accessibili, sono strutturate come FAQ. Anche i bibliotecari possono essere interessati agli argomenti trattati, per la loro attività di supporto alla ricerca.
Vi ricordo anche questo sito della Elsevier (estremamente interessante): Elsevier  Early career researchers

PubMed e gli "Altri Abstract"

I bibliotecari biomedici americani segnalano una curiosità di PubMed. Alcuni record che non hanno abstract possono avere degli "abstract alternativi", che possono essere stati scritti dopo la pubblicazione dell'articolo o da altri partner. In questo caso l'abstract è presente nel campo del record di PubMed contrassegnato dall'etichetta OAB. Questo campo del record è visibile solo se il record viene visualizzato nel formato (Format): MEDLINE oppure Abstract (text). Per saperne di più leggere la guida e non abbandonare le speranze difronte a un record senza riassunto...

Strumenti 2.0 per Ricercatori

Bibliosan 2.0 è sempre aggiornato e ricco di informazioni utili ai ricercatori, vi segnalo un post che analizza strumenti per la scrittura a più mani e segnala un articolo che li compara.
Inoltre suggerisce un articolo pubblicato su Nature che analizza vari strumenti creati per i ricercatori, che permettono loro di raccoglie e organizzare le molteplici informazioni, provenienti da fonti diverse.

Data Journals e Mega-Journals

Il blog Bibliosan 2.0 presenta una notizia sui Data Journals che pubblicano set di dati e allegati con struttura di paper e rinvia ad un articolo di:
Candela, L., Castelli, D., Manghi, P. and Tani, A. (2015), Data journals: A survey. Journal of the Association for Information Science and Technology. doi: 10.1002/asi.23358
e ad una guida: Data Journals Guide.
Oltre ai Data Journals, Bibliosan 2.0 presenta una notizia sui Mega-Journals, riviste  open access multidisciplinari, in sperimentazione presso molti editori scientifici e commerciali.

Ricerche in PubMed e Diagrammi di Venn

Dalla lista dei bibliotecari medici americani, l'indicazione di uno strumento PubVenn per visualizzare con i diagrammi di Venn le ricerche di PubMed (se i termini sono più di tre si possono verificare delle inesattezze). Da provare ...

PubMed - Novità nel 2015

Un elenco di novità di PubMed nel 2015:
- PubMed Summary Display: sparisce nel formato Summary di display del record l'indicazione dello status del record, ad es. [PubMed - as supplied by publisher]; [PubMed – indexed for MEDLINE], che è ancora possibile vedere nel formato del record PubMed Abstract and Abstract (text);
- New Name for PubMed Related Citations Discovery Tool: "Related citations" per i record di PubMed, a partire da giugno verrà rinominato "Similar articles";
- PubMed Save Search Link Renamed: sotto la stringa di ricerca di PubMed trovate i due link (appena rinominati), Create RSS (per creare un feed per la riceerca che avete impostato) e Create alert (per creare un alert per ricevere via email  gli aggiornamenti della vostra strategia di ricerca);
- PubMed subject filters:  i filtri di PubMed sono stati rivisti e aggiornati.

Bibliometria: Articolo di PNAS sulle "Sleeping Beauties"

E' apparso sulla rivista PNAS un articolo di Alessandro Flammini e dei suoi collaboratori della Indiana University che analizza il fenomeno delle "Belle Addormentate", cioè delle pubblicazioni scientifiche che restano "dormienti" per anni e solo dopo molti anni vengono citate da pubblicazioni dello stesso o di diverso ambito scientifico.
L'analisi è estremamente interessante (leggere l'articolo nel formato PDF + SI che contiene i dettagli dello studio), il fenomeno riguarda soprattutto discipline quali la fisica, la chimica e anche la statistica.
Ecco i riferimenti bibliografici dell'articolo:
Ke Q, Ferrara E, Radicchi F, Flammini A. Defining and identifying Sleeping
Beauties in science. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Jun 16;112(24):7426-31. doi:
10.1073/pnas.1424329112

E' interessante anche un articolo di Daniel Cressey pubblicato su Nature (News) il 25 Maggio, che analizza l'articolo di PNAS e fornisce nuovi spunti di riflessione.

HLWIKI International: Wiki per Bibliotecari medici (e non solo)

Segnalo HLWIKI, che include 10 portali per bibliotecari medici, informazioni su social media e tecnologia. Questo wiki  viene curato da un gruppo internazionale (da Canada, Spagna, Olanda) di bibliotecari biomedici. Il sito è molto interessante e aggiornato, tra i molti argomenti trattati sono di particolare interesse quelli contenuti nella sezione "Managing health library portals" e in particolare "Scholarly publishing and communication"

PubMed e Ricerche sulla Nutrizione

Vi segnalo un articolo di Eric Rumsey e Janna Lawrence, bibliotecari medici (Iowa University of Iowa Libraries) che evidenziano alcune difficoltà nell'uso di PubMed per le ricerche sulla nutrizione. da vedere anche il loro interessante blog, dove potete trovare altre analisi su PubMed e la ricerca di informazioni mediche.

Informa healthcare - The Reading Room

Nella pagina The Reading Room trovate una selezione di articoli ad accesso libero dell'editore scientifico Informa healthcare.

Cercare con Google le Tesi dell'Università di Padova

Un suggerimento per cercare con una parola chiave o il nome di un autore le tesi (di laurea e di dottorato) contenute negli archivi dell'Università di Padova, inserire nella stringa di ricerca:
parolachiave site:paduaresearch.cab.unipd.it OR site:tesi.cab.unipd.it

esempio: aloe site:paduaresearch.cab.unipd.it OR site:tesi.cab.unipd.it

Orto Botanico di Padova - Fascicolo monografico di "PADOVA e il suo territorio"

La rivista di storia arte e cultura "PADOVA e il suo territorio" dedica un intero fascicolo (N. 174 Aprile 2015) all'Orto Botanico di Padova, con articoli che focalizzano l'attenzione sulla sua storia e sulla nuova realizzazione del Giardino della biodiversità. Purtroppo non troverete notizie di questo fascicolo nel sito web della rivista, potete acquistarlo nelle edicole di Padova.

PubMed - Ricerca Bibliografica su Nutrizione e Salute

Vi segnalo un articolo che sottolinea le "falle" di PubMed nella ricerca di informazioni che riguardano i rapporti cibo e salute. L'articolo suggerisce poi dove trovare le stategie per colmare le lacune e riuscire a recuperare le informazioni. Il sito di riferimento è sempre quello del blog della University of Iowa Libraries e il post dal titolo: "FOOD-DIET AND NUTRITION - An Inclusive PubMed Search" è stato scritto da Eric Rumsey

Cochrane Library - Novita'

Tra le risorse del nostro ateneo è presente la base dati Cochrane Library  (accesso dal Portale AIRE).
La base dati ha una nuova interfaccia. Nella nuova versione è presente anche questa risorsa:
COCHRANE CLINICAL ANSWERS
http://www.cochranelibrary.com/more-resources/cochrane-clinical-answers.html
che permette al medico, partendo da un quesito clinico, di essere reindirizzato (link) alle Cochrane Systematic reviews pertinenti. Il servizio è ancora in fase di sviluppo, ma si affianca a quello fornito ai clinici da UptoDate (disponibile per la sola rete di Medicina).
La notizia è stata pubblicata sul blog dei colleghi americani della University of Iowa Libraries
http://blog.lib.uiowa.edu/needtoknow/2015/01/28/new-resource-cochrane-clinical-answers/

Farmaci ad Alto Rischio - Una Systematic Review sugli Errori Medici (EM)

Segnalo una "systematic review"  che analizza l'impatto degli errori di somministrazione dei farmaci sulla salute dei pazienti. L'articolo è stato pubblicato sulla rivista European Journal of Clinical Pharmacology 2014, vol. 70(6), 637-645
http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00228-014-1668-z

Nell'articolo si fa riferimento al sito della WHO "International language for drug utilization research ATC/DDD", dove è possibile trovare il full text della guida: ATC classification and DDD assignment 2015

IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY e altro sui Farmaci

La guida è una risorsa open access che fornisce dati farmacologici, chimici, genetici, funzionali e patofisiologici ai target di farmaci approvati e in fase di sperimentazione. E' il risultato della collaborazione ed integrazione dei dati forniti dallo IUPHAR (International Union of Basic and Clinical Pharmacology) e dalla BPS (British Pharmacological Society).
Per ulteriori informazioni leggere l'articolo pubblicato nella rivista open access Nucleic Acids research 2014, vol 42, D1098-D1106  doi:10.1093/nar/gkt1143
http://nar.oxfordjournals.org/content/42/D1/D1098

Usare Google Scholar per l'Analisi delle Citazioni

Suggerimenti e le novità nella ricerca dei titoli degli articoli scientifici con Google Scholar e il suo utilizzo per l'analisi citazionale si possono trovare nel blog EducatorGold

Integrazione di Medicina Tradizionale Cinese e Medicina Occidentale?

La rivista Science pubblica un supplemento dal titolo "The Art and Science of Traditional Medicine". Il supplemento è suddiviso in tre parti, due delle quali sono già state pubblicate con il titolo:
Part 1 - TCM Today - A Case for Integration
Science 19 December 2014, vol. 346 no. 6216 p. 1569
DOI: 10.1126/science.346.6216.1569-d

Part 2 - Multidisciplinary Approaches for Studying Traditional Medicine
Science 16 January 2015, vol. 347 no. 6219 p. 337
DOI: 10.1126/science.347.6219.337-c

Free DOI lookup

Nella pagina di crossref.org potete cercare il numero di DOI di un articolo o conoscendo il DOI recuperare l'articolo che vi interessa.

Tossicologia - Siti Utili

Vi segnalo questo ebook di tossicologia ad accesso gratuito
http://www.toxipedia.org/display/hwt/A+Small+Dose+of+Toxicology%2C+2nd+Edition

e la base dati bibliografica SafetyLit
http://www.safetylit.org/index.htm

"... this database "provides abstracts of reports from researchers who work in the more than 30 professional disciplines relevant to preventing unintentional injuries, violence, and self-harm. Among these are anthropology, economics, education, engineering specialties, ergonomics and human factors, health and medicine, law and law enforcement, psychology, sociology, and other fields. SafetyLit staff and volunteers regularly hand-examine (issue by issue) more than 3400 current scholarly journals from many nations to find relevant material. This information is maintained in a searchable database that contains more than 225 thousand items. The database contains articles from 4405 journals that are not included in PubMed/Medline." ..."

E' una delle risorse gratuite utili per la tossicologia segnalate nella pagina web della Sheldon Margen Public Health Library (Univ. of California, Berkeley Library)http://www.lib.berkeley.edu/PUBL/tox.html
       

Politiche del Farmaco - Nuova Rubrica delle Riviste Italiane aderenti alla ISDB

Le quattro riviste italiane aderenti a ISDB (International Society of Drug Bulletin) hanno creato un sito ad accesso gratuito "Politiche del Farmaco".
Questa rubrica ha l’ambizione di commentare, potenzialmente, ogni proposta, iniziativa, decisione che abbia un minimo rilievo nel campo del farmaco (registrazione, valutazione, politiche dei prezzi, attività dell'AIFA e dell'EMA ecc.)

Cultura Scientifica ad Accesso Aperto - Un Glossario

Un glossario per capire meglio la terminologia utilizzata nella cultura dell'accesso aperto all'informazione scientifica, lo trovate in un post di EGU Blogs.

Come Trovare la Rivista più Adatta a Pubblicare il Proprio Lavoro Scientifico?

Alcuni siti web possono essere di ausilio per selezionare le riviste da contattare per la pubblicazione di articoli. Questi siti sono interessanti non solo per i ricercatori ma anche per i bibliotecari (quali riviste pubblicano articoli su determinati argomenti? in quali database sono indicizzati gli articoli?).

Il blog scientifico Bibliosan ne seleziona alcuni:
JournalGuide
 Journalysis
 JournalRate
 SciRev
 Cofactor selector tool
 QOAM (Quality Open Access Market)

Predatory Journals and Open Access

Sempre più all'attenzione il comportamento poco corretto di alcuni editori di riviste Open Access. La rivista BMJ pubblica un editoriale di Jocalyn Clark e Richard Smith dal titolo "Firm action needed  on predatory journals" BMJ 2015;350:h210
http://www.bmj.com/content/350/bmj.h210.long
E' stata anche pubblicato l'aggiornamento della Beall' list degli editori Open Access potenziali predatori (aggiornamento 26 Gennaio 2015)

PubMed - Suggerimenti per la Ricerca nella Base Dati e Riflessioni

La ricerca in PubMed con il tesauro MeSH è un buon punto di partenza, anche per trovare il/i termine/i più efficace per il recupero delle informazioni che ci interessano. E' spesso necessario integrarla con la ricerca libera che permette di recuperare gli articoli più recenti, che non hanno ancora i descrittori MeSH (non usiamo le restrizioni temporali presenti nell'opzione Limit, sono termini MeSH!).
Se ho già fatto la ricerca con l'ausilio del tesauro e voglio fare una ricerca con un termine libero, escludendo i record che ho già recuperato con il MeSH posso usare due strategie:
1. scrivo nel campo Search la stringa:
il mio termine libero NOT ricerca con il termine[MeSH]
esempio: (ebola virus) NOT ebolavirus[MeSH]
2. scrivo nel campo Search la stringa:
il mio termine libero NOT medline[sb]
esempio: (ebola virus) NOT medline[sb]

Attenzione però i risultati sono diversi, perché con la seconda stringa elimino dalla mia ricerca tutti i record che presentano l'etichetta [PubMed - indexed for MEDLINE], cioè tutti il record della base dati MEDLINE e quindi non solo quelli che hanno il termine MeSH che voglio escludere.

Questo è  un aspetto critico nel caso di termini MeSH adottati di recente dal tesauro e che quindi negli anni precedenti non potevano essere usati dagli indicizzatori di MEDLINE per descrivere il contenuto dei record inseriti nella base dati (e nel caso di ricerche retrospettive). Con la strategia 2 perdo queste informazioni bibliografiche!

 

EMA sospende alcuni Farmaci GVH Biosciences

Tutte le informazioni nel sito della European Medicines Agency, dove viene pubblicato l'elenco dei farmaci commercializzati nei vari stati europei (Italia inclusa).
 Nel sito dell' EMA le ultime novità su farmaci per uso umano e veterinario e piante medicinali. Per cercare notizie su un farmaco, una pianta medicinale, una patologia usare l'opzione "Find medicine"

Biblioteca Digitale della Biblioteca Nazionale Marciana di Venezia

La Biblioteca digitale della Marciana è un vero tesoro di informazioni consultabile online. Sono presenti cataloghi di incunaboli, cataloghi storici, immagini, GeoWeb (una base dati di materiali cartografici e storici), un archivio digitale della musica, immagini sacre e altre cose ancora da scoprire...

EuroStemCell e il database StemDB

EuroStemCell nasce da un progetto della Comunità Europea e raccoglie informazioni e risorse diverse riguardanti la ricerca sulle cellule staminali  (in 6 lingue diverse). Ospita il database StemDB.

World Library of Science (WLoS) - Una Biblioteca Virtuale (e non solo) per Ricercatori e Docenti

World Library of Science (WLoS) nasce dalla collaborazione tra UNESCO, l'editore Nature e la casa farmaceutica Roche, è una risorsa completamente gratuita a disposizione di studenti e ricercatori. E' una biblioteca virtuale che consente l'accesso ad articoli, ebooks e video forniti da Nature, ma anche una piattaforma digitale che consente l'accesso a strumenti per l'apprendimento e consente i collegamenti tra comunità di ricercatori e docenti.
(Fonte: S&I BibliosanNews n.33 gennaio 2015)

ETHICSWEB - Un portale per le Scienze Biomediche

Ethicsweb è un portale europeo che raccoglie e rende accessibili informazioni sull'etica nelle scienze. I dati provengono da risorse diverse: basi dati (incluso Pubmed), leggi, regolamenti, materiale di ricerca, materiale didattico ecc.

Blog e Siti di interesse per Bibliotecari e Ricercatori Biomedici

Segnalo il blog Bibliosan 2.0 ricco di informazioni e aggiornamenti e il sito web Politiche del Farmaco che raccoglie e pubblica la sintesi degli articoli comparsi sulle riviste ISDB, cioè riviste indipendenti che per le loro pubblicazioni non ricevono contributi dalle aziende farmaceutiche (vedere l'elenco delle riviste italiane).

Google - Informazioni utili

Nel sito del Corriere della Sera/Tecnologia, Elmar Burchia illustra "I 17 trucchi che cambieranno le vostre ricerche su Google"
Nel blog Bibliosan 2.0 una notizia sui componenti aggiuntivi di Google Drive e il link al video-tutorial.